說明書(shu)
特點優(you) 勢:
1. 特異性:所有產(chan) 品使用的引物均經過詳盡的生物信息學分析,經過GenBank及自建龐大數據庫的比對,確保所用的每一條引物均為(wei) 種屬或血清型特異的基因序列區段,可實現對細菌種屬及血清型的特異檢測,特異性均達到100%。
2. 重現性:該係列所有產(chan) 品均經過大量實驗菌株的驗證,重現性為(wei) 100%。
3. 靈敏性:該係列產(chan) 品可實現對檢測菌的高靈敏檢測,當樣品中細菌的濃度達到103cfu/ml時,可實現對其的直接檢測,無需繁瑣的增菌過程。
4. 實用性:檢測範圍廣,涵蓋了對人體(ti) 危害較為(wei) 嚴(yan) 重的17種呼吸道及腸道致病菌,可實現對臨(lin) 床樣品及其他環境取樣的快速檢測,整個(ge) 檢測過程為(wei) 3-4個(ge) 小時。
5. 優(you) 勢1:序列資源豐(feng) 富,除GenBank公布的序列外,公司還進行了大量菌株的序列破譯,從(cong) 理論上保證所選引物具有良好的保守性和特異性。
6. 優(you) 勢2:該係列試劑盒均經過大量的保守性及特異性實驗驗證,憑借公司擁有的豐(feng) 富的菌種資源,每一種檢測試劑盒均經過了20餘(yu) 種標準菌株和臨(lin) 床菌株的保守性驗證及40餘(yu) 種近緣標準菌株和臨(lin) 床菌株的特異性驗證,確保在使用過程中不會(hui) 出現任何的假陽性及假陰性報告結果。
PCR使用方法:
一、樣品 DNA 的製備
1. 用自選方法純化樣品的 DNA,本產(chan) 品跟市場上絕大多數核酸純化產(chan) 品兼容。
2. 如果有 N 個(ge) 樣品,則需要進行 N+2 個(ge) 樣品提取,多出的一個(ge) 用作樣品製備陽性對照管、另一個(ge) 用作樣品製備陰性對照管。如果用本試劑盒自帶的 DNA 釋放劑試用裝。則按下麵步驟操作:
3. 配製溶液 A 工作液。以配製 1mL 工作液(足夠 10 個(ge) 樣品)為(wei) 例:在一幹淨塑料
管中加入 10uL 溶液 A 成分一,20uL 溶液 A 成分二和 970uL 超純水,充分混合均勻即可。溶液 A 工作液可室溫放置,但最好在一周內(nei) 用完,不要長期放置。一次檢測一個(ge) 樣品需要 100uL 溶液 A 工作液,1mL 工作液足夠 10 個(ge) 樣品。如果待測樣品數量為(wei) 其他數字,
配製的溶液 A 工作液的體(ti) 積需要做相應的調整。
4. 在標記好的 N+2 個(ge) 離心管中,加入 1-5mg 固體(ti) 樣品(半粒芝麻大小,如奶酪)或5uL 液體(ti) 樣品(如牛奶)待測樣品。在樣品製備陽性對照中加入 5uL 陽性對照,在樣品製備陰性對照中加入 5uL 水。
5. 在每個(ge) 管中加入 100 uL 溶液 A 工作液,確保固體(ti) 樣品被溶液淹埋,如果是液體(ti) 樣品則震蕩混勻。
6. 95℃保溫 10 分鍾。
7. 待冷卻到常溫後加入 10uL 溶液 B 並混勻得 DNA 釋放液。每個(ge) 樣品得到的 DNA釋放液足夠進行 50-100 次 PCR。
實驗規則:
1、要保證移液槍的準確性,誤差不能超過2%。可用水和電子天平進行確定。但有專(zhuan) 業(ye) 人員進行矯正。
2、要配備20ul、50ul、100ul、1000ul和排槍各一支。吸取不同的液體(ti) 後,要更換槍頭。即使是吸取標準品時。
3、要在實驗前1小時將試劑盒從(cong) 冰箱中取出,使各種試劑都恢複到室溫,以使結果更穩定。
4、實驗時,要使底物避光保存。
5、用槍吸取液體(ti) 時速度不能太快,以免產(chan) 生氣泡而使吸取量不準確。
6、吸取液體(ti) 時,要用量程和需要量接近的槍去吸,減少誤差。
7、將液體(ti) 加到酶標孔中時,避免槍頭和孔內(nei) 液體(ti) 接觸,可使槍頭上的液滴和孔壁接觸,液滴會(hui) 自然流下去。
8、液體(ti) 全部加完後,可將酶標板在桌子上平行輕輕晃動30秒,混勻液體(ti) 。也可以用酶標儀(yi) 的晃動功能。
9、應盡量做雙孔實驗,這樣才能保證數據的準確性。
10、對結果有疑問的樣品要用其它方法進行確證。
PCR反應流程常規程序
將PCR反應所需的成分配置完後,在PCR儀(yi) 上於(yu) 94-96℃預加熱幾十秒至幾分鍾,使模板DNA充分變性,然後進入擴增循環。在每一個(ge) 循環中,先於(yu) 94℃保持30秒鍾使模板變性,然後將溫度降到複性溫度(一般50-60℃之間),一般保持30秒鍾,使引物與(yu) 模板充分退火;在72℃保持1分鍾(擴增1kb片段),使引物在模板上延伸,合成DNA,完成一個(ge) 循環。重複這樣的循環25~35次,使擴增的DNA片段大量累積。最後,在72℃保持3-7min,使產(chan) 物延伸完整,4℃保存。
2.複性(退火)和延伸溫度
複性的溫度是PCR擴增是否順利的關(guan) 鍵因素,通常在50-60℃之間。具體(ti) 的溫度主要由引物的Tm值決(jue) 定。延伸溫度絕大多數設定為(wei) 72℃。如果複性的溫度很高,可以將延伸溫度和複性溫度設置成同一溫度,變成二步法PCR。
3.反應時間
變性步驟一般使用30秒鍾,如果模板的G+C含量較高,或直接用細胞做模板,變性時間可適當延長。複性時間有30秒種一般是足夠的。延伸時間由擴增產(chan) 物的大小決(jue) 定,一般采用1kb用1分鍾來保證充足的時間。
4.循環次數
循環次數主要與(yu) 模板的起始數量有關(guan) ,在模板拷貝數為(wei) 104~105數量級時,循環數通常為(wei) 25~35次。
平台效應(plateaueffect):PCR擴增過程後期會(hui) 出現的產(chan) 物的積累按減弱的指數速率增長的現象。原因:底物和引物的濃度已經降低,dNTP和DNA聚合酶的穩定性或活性降低,產(chan) 生的焦磷酸會(hui) 出現末端產(chan) 物抑製作用,非特異性產(chan) 物或引物的二聚體(ti) 出現非特異性競爭(zheng) 作用,擴增產(chan) 物自身複性,高濃度擴增產(chan) 物變性不*。
5.PCR反應液的配製
PCR反應體(ti) 係的配置方式有時也會(hui) 影響反應的正常進行。常規方法與(yu) 其它酶學反應一樣,在最後加入DNA聚合酶。早期的PCR儀(yi) 沒有帶加熱的蓋子,要求在反應液上覆蓋一層礦物油,防止水分蒸發。
對於(yu) 使用具3’-5’外切活性的高溫DNA聚合酶時,有時會(hui) 擴增不出產(chan) 物。在遇到這個(ge) 問題時,如果將反應成分分開配製,A管含模板、引物和dNTP,以及調整體(ti) 積的H2O,B管含緩衝(chong) 液、DNA聚合酶和水,然後再將兩(liang) 管溶液混合起來,可較好地克服這個(ge) 問題。
按照常規的方法配製反應體(ti) 係,有時會(hui) 出現非特異性擴增的問題。熱啟動(hotstart)PCR操作方式可較好解決(jue) 這一問題。將dNTP、緩衝(chong) 液,Mg2+和primer先配製好,然後加入一粒蠟珠(如AmpliWaxPCRQam100),加熱熔化,再冷卻,使蠟將溶液封住,最後加入模板和DNA聚合酶等剩餘(yu) 成分。隻有當PCR反應進入高溫階段後,蠟層熔化,所有反應成分才會(hui) 混合在一起。
實驗注意事項:
1)RT-PCR可以檢測組織、細胞、血液、細菌等很多材料,不同的樣本有不同要求,實驗前請充分溝通確認實驗方案和樣本情況;
2)客戶盡可能提供實驗的背景信息、物種、基因準確的名稱和ID號;
3)客戶盡量不要提供DNA或RNA樣品。
4)樣本保存於(yu) 液氮或幹冰,也可以保存於(yu) Trizol液中。
實時熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)是指在PCR反應體(ti) 係中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監測整個(ge) PCR進程,*通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。實時熒光定量PCR的化學原理包括探針類和非探針類兩(liang) 類,探針類是利用與(yu) 靶細胞序列特異性雜交的探針來指示擴增產(chan) 物的增加,非探針類是利用熒光染料或者特異性設計的引物來指示擴增的增加。運用該技術可以對DNA、RNA樣品進行定量(包括*定量和相對定量)和定性分析。
主要服務:DNA或RNA的*定量分析、基因表達差異分析、基因分型。
主要技術:引物設計、RNA提取、cDNA合成、qPCR。
試劑使用須知:
(1)請參照相關(guan) 法規、文獻、MSDS等信息,理解並掌握好試劑的特性,再進行安全操作。產(chan) 品僅(jin) 用於(yu) 科研
(2)通常購買(mai) 試劑時一定要想到一次性用完。若估算不足有剩餘(yu) 的話,更加注意其他保管和管理。
(3)萬(wan) 一試劑操作者並非專(zhuan) 業(ye) 技術人員。必須在專(zhuan) 業(ye) 人士的指導監督下進行操作。對於(yu) 使用後的廢棄物,不要或者舊的試劑,應按照相關(guan) 法律法規正當處理。
(4)購買(mai) 後,請務必確認標簽上的注意事項;做好預防顛倒,摔壞的措施和管理體(ti) 製;在使用前再次確認標簽上的注意事項,做好必要的安全對策;對沒有標明其危害特性、有害特性的,也要慎重地進行操作;必須帶好防護用具,小心翼翼進行操作。
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