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谘詢電話:18321818584流行性造血器官壞死病毒(EHNV)熒光 PCR 檢測試劑盒說明書(shu)
、試劑盒簡介貨
主要感染當年草魚種和青魚,死亡率可達80%以上。其它淡水鯉科魚,如鰱魚、鱅魚、鯽魚、鯉魚感染後沒有臨(lin) 床症狀,但可以攜帶病毒到處傳(chuan) 播。該病在水溫高於(yu) 20℃以上時流行, 25~28℃為(wei) 流行高峰。常見的臨(lin) 床症狀為(wei) 眼突出、體(ti) 色發黑,口腔、鰓蓋和鰭條基部出血。撕開表皮,可見肌肉出現點狀或塊狀出血。剖檢腹腔, 可見腸道充血, 肝、脾充血或因失血而發白。病原為(wei) 草魚呼腸孤病毒(Grass carp reovirus,GCRV),是水生呼腸孤病毒屬(Aquareovirus)的成員。病毒為(wei) 直徑70nm的球形顆粒,有雙層衣殼,無囊膜,含有個(ge) 片段的雙鏈RNA。根據片段長度大小分為(wei) 大(L、L2、L3,大小在4.0kb~3.7kb)、中(M4、M5、M6,大小在2.5~2.0kb)、小(S7、S8、S9、S0、S, 大小在.6~.0kb) 三組。在不同地區存在抗原性、核酸電泳圖譜、對細胞的敏感性和對魚的毒力都有一定差異的毒株。多年研究已經確定的有二個(ge) 典型的代表株:GCRV-873為(wei) 湖南株,能在CO、CIK等細胞中大量增殖並出現CPE,症狀以內(nei) 髒出血為(wei) 主;GCRV-904為(wei) 湖北株,能在CIK、CO細胞中大量增殖,但不產(chan) 生CPE,症狀以肌肉出血為(wei) 主。在核酸序列上GCRV-904株和GCRV-873株的同源性不到8%。為(wei) 了適應草魚出血病(GCRV)快速檢測和疫病研究的需要,本公司嚴(yan) 格依據SN/T3584-203草血病檢疫技術規範規定的檢測GCRV-904株病毒的引物序列及其循環參數等技術標準,在本公司嚴(yan) 謹的產(chan) 品質量保證體(ti) 係管控下生產(chan) 和質檢。確保本試劑盒滿足標準的檢測要求。本試劑盒具有快速靈敏、特異、準確、安全、操作簡單、應用廣泛等特點及優(you) 點。
2、試劑盒組成
試劑盒組成包括核酸擴增試劑。具體(ti) 組成參見表 :
表 :試劑盒組成(50test/盒)
試劑盒組成成分 體(ti) 積
核酸提取試劑: 核酸裂解液 5ml×2 管
核酸擴增試劑: DEPC 水
GCRV-904 RT-PCR 反應液
酶混合物陰性對照
GCRV-904 陽性對照 ml× 管
750µL× 管
60µL× 管
ml× 管
ml× 管
(注:核酸提取試劑可使用本公司生產(chan) 的提取核酸更快捷方便的《病毒 RNA 柱式提取試劑盒》)
3、樣本采集,存放及運輸
3.樣本采集:所用取樣器材必須經高壓滅菌並烘幹。
取新鮮魚類組織髒器(肝、腦、脾、腎)2g 於(yu) 已洗淨、滅菌並烘幹的研缽中充分研磨,加 5ml PBS 混勻,2 000r/min 離心 0min 取上清轉入無菌離心管中備用。或取有可疑細胞病變的細胞懸液用於(yu) 檢測。
3.2存放:研磨後的樣本在 2 ℃—8 ℃條件下保存應不超過 24 h;-70 ℃以下可保存,但應避免反複凍融(zui多凍融 3 次)。
3.3運輸:采用冰或泡沫箱加冰密封進行運輸。
4、一步法 RT-PCR 檢測
4.操作方法
4..樣本的處理(在樣本製備區進行):
4...取 n 個(ge) 滅菌的 .5 mL Eppendorf 管,其中 n 為(wei) 被檢樣品與(yu) 陰性對照的和(陽性對照、陰性對照在試劑盒中已標出),做標記。(注:試劑盒中的陽性對照直接作為(wei) PCR 檢測的模板,無需提取核酸)
4...2每管加入 600 L 裂解液,分別加入被檢樣本和陰性對照各 200 L,一份樣本換用一個(ge) 吸頭,再加入 200 L 氯,混勻器上振蕩混勻 5 s(不能過於(yu) 強烈,以免產(chan) 生乳化層,也可以用手顛倒混勻),於(yu) 4℃ 2 000 r/min 離心 5 min。
4...3取與(yu) 4... 相同數量滅菌的 .5 mL Eppendorf 管,加入 500 L 異丙醇(-20℃預冷), 做標記。吸取 4...2 各管中的上清液轉移至相應的管中,上清液應至少吸取 500L,不能吸出中間層,顛倒混勻。
4...4於(yu) 4 ℃、2 000 r/min 離心 5 min(Eppendorf 管開口保持朝離心機轉軸方向放置),小心倒去上清,倒置於(yu) 吸水紙上,沾幹液體(ti) (不同樣品須在吸水紙不同地方沾幹);加入 600 L 75% 乙醇,顛倒洗滌。
4...5於(yu) 4 ℃、2 000 r/min 離心 0 min(Eppendorf 管開口保持朝離心機轉軸方向放置),小心倒去上清,倒置於(yu) 吸水紙上,盡量沾幹液體(ti) (不同樣品須在吸水紙不同地方沾幹)。
4...64 000 r/min 離心 0s(Eppendorf 管開口保持朝離心機轉軸方向放置),將管壁上的殘餘(yu) 液體(ti) 甩到管底部,小心倒去上清,用微量加樣器將其吸幹,一份樣本換用一個(ge) 吸頭,吸頭不要碰到有沉澱一麵,室溫幹燥 3 min,不能過於(yu) 幹燥,以免 RNA 不溶。
4...7加入 L DEPC 水,輕輕混勻,溶解管壁上的 RNA,2 000 r/min 離心 5 s,冰上保存備用。提取的 RNA 須在 2 h 內(nei) 進行 PCR 擴增;若需保存須放置-70 ℃冰箱內(nei) 。
【也可參照《病毒 RNA 柱式提取試劑盒說明書(shu) 》(貨號:HB-QPCR-0)使用,更方便快捷提取核酸】。
注:提取的 RNA 須在 2 h 內(nei) 進行 PCR 擴增;若需保存須放置-70 ℃冰箱內(nei) 。
4.2、試劑準備
4.2.擴增試劑準備(在反應混合物配製區進行):
從(cong) 試劑盒中取出相應的一步法RT-PCR反應液、RT-PCR混合酶,在室溫下融化後,2 000 r/min 離心5 s。設所需一步法RT-PCR檢測總數為(wei) n,其中n為(wei) 被檢樣品、陽性對照與(yu) 陰性對照的和,每個(ge) 樣品測試反應體(ti) 係配製見下表2。
表 2 每個(ge) 樣品測試反應體(ti) 係配製表
試劑 RT-PCR 反應液 RT-PCR 混合酶
用量 5 μL .0 μL
根據測試樣品的數量計算好各試劑的使用量,加入到適當體(ti) 積試管中,充分混合均勻,向每個(ge) 一步法RT-PCR管中各分裝5 μL,轉移至樣本處理區。
4.2.2加樣(在樣本處理區進行):
在各設定的一步法RT-PCR管中分別加入上述樣本處理步驟4...7中製備的RNA溶液各0μL,蓋緊管蓋,500 r/min離心30s。
4.3、檢測(在檢測區進行):
將4.2.2中離心後的PCR管放入PCR檢測儀(yi) 內(nei) ,記錄樣本擺放順序。循環條件設置如下: 一階段:42 oC/30 min;
第二階段:94 oC/4 min;
第三階段:94 oC/ min, 55 oC/ min,72 oC/ min, 30個(ge) 循環; 第四階段,72 oC/8 min;
第五階段,4 oC 保存。
4.4、瓊脂糖電泳
用電泳緩衝(chong) 液製備.5%的瓊脂糖凝膠平板。將平板放入水平電泳槽,使電泳緩衝(chong) 液剛好淹沒膠麵。將0μL樣品PCR擴增產(chan) 物和相應電泳上樣緩衝(chong) 液(Loading Buffer)按比例混勻後加入樣品孔。在電泳時設立DNA標準分子量作對照。5 V/cm電泳約0.5 h,當溴酚藍到達底部時停止。在紫外燈下或凝膠成像儀(yi) 的紫外透射光下觀察是否擴增初預期的特異性DNA電泳帶,拍攝並記錄。
5、結果判定
5.一步法RT-PCR後陽性對照出現一條320bp的DNA段。陰性對照和空白對照沒有該核酸帶。
5.2待測樣品在相應 320 bp DNA 位置上有帶,可判陽性。
6、相關(guan) 技術信息
F: 5’-acgtg cgatt ggaag agctt- 3’ R: 5’-agttc tcaaa gctga gacag- 3’
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