反應五要素:
參加PCR反應的物質主要有五種即引物、酶、dNTP、模板和Mg2+
引物: 引物是PCR特異性反應的關(guan) 鍵,PCR 產(chan) 物的特異性取決(jue) 於(yu) 引物與(yu) 模板DNA互補的程度。理論上,隻要知道任何一段模板DNA序列,就能按其設計互補的寡核苷酸鏈做引物,利用PCR就可將模板DNA在體(ti) 外大量擴增。
設計引物應遵循以下原則:
①引物長度: 5-30bp,常用為(wei) 20bp左右。
②引物擴增跨度: 以200-500bp為(wei) 宜,特定條件下可擴增長至0kb的片段。
③引物堿基:G+C含量以40-60%為(wei) 宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現非特異條帶。ATGC好隨機分布,避免5個(ge) 以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。
④避免引物內(nei) 部出現二級結構,避免兩(liang) 條引物間互補,特別是3’端的互補,否則會(hui) 形成引物二聚體(ti) ,產(chan) 生非特異的擴增條帶。
⑤引物3’端的堿基,特別是zui末及倒數*個(ge) 堿基,應嚴(yan) 格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導致PCR失敗。
⑥引物中有或能加上合適的酶切位點,被擴增的靶序列zui有適宜的酶切位點,這對酶切分析或分子克隆很有好處。
⑦引物的特異性:引物應與(yu) 核酸序列數據庫的其它序列無明顯同源性。
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