78個細菌基因組的Z初分析

    美國國立衛生研究院人類微生物（Human Microbiome Jumpstart Reference Strains Consortium）旗下的人類微生物Jumpstart代表菌株聯盟（Human Microbiome Jumpstart Reference Strains Consortium）的研究人員公布了微生物基因組測序計劃中的頭78個(ge) 與(yu) 人類宿主有關(guan) 的細菌基因組序列的zui初的分析。hth体育下载地址

    由於(yu) 二十世紀90年代啟動的人類基因組計劃（HGP）以當時的技術水平要在5年內(nei) 完成這一計劃任務是很艱巨的。為(wei) 了順利完成人類基因組特別是功能基因組計劃，科學家們(men) 同時也啟動了模式生物基因組計劃，以期探討序列測定的新技術新方法以及確定基因功能的表達模式，其中包括大腸埃希菌、流感嗜血杆菌、釀酒酵母等微生物。

    在過去的0年中，微生物學領域得到巨大的轉變，這部分是由於(yu) 坐落在馬裏蘭(lan) 州洛克菲勒市的基因組研究所（TIGR）的基因組測序儀(yi) 的幫助。TIGR的科學家們(men) 發表了zui初三個(ge) 完整的微生物基因組序列——Haemppholus influenzae, Mycoplasma genitalium與(yu) Methanococcus jannaschii，並且隨後完成了至2004年月份完成與(yu) 發表的50個(ge) 微生物基因組中的40個(ge) 。hth体育下载地址

    研究人員將與(yu) 其他人共享他們(men) 的數據，這樣其他的遺傳(chuan) 學家如果試圖從(cong) 自然環境中對大量的微生物基因組做直接采樣的話，他們(men) 可以參考這些數據。這一對我們(men) 身體(ti) 上的微生物的更好的理解會(hui) 在將來對了解某些人類的疾病提供線索。

    研究人員研發了對在其自然環境中的微生物進行大規模基因組測序的標準化方法，他們(men) 的目標之一是為(wei) 至少900種將人體(ti) 稱為(wei) 住所的細菌製作出參照基因組序列。目前公開的是頭78個(ge) 與(yu) 人類宿主有關(guan) 的細菌基因組序列的zui初的分析。 到目前為(wei) 止，這些結果給未來的分析工作提供了一個(ge) 重要的基線，盡管這些研究人員說，他們(men) 隻是剛剛觸及了人類“微生物組”的表麵而已。

    機體(ti) 除受自身基因的調控外，還受到大量的共生細菌的影響。這些細菌大部分寄生在人的腸道中，通稱為(wei) 腸道菌群，在學術界常被稱作“人體(ti) 腸道元基因組”。該項研究成果收集了24個(ge) 來自於(yu) 歐洲人腸道菌群的樣本，采用了新一代大規模高通量的測序技術進行深度測序，產(chan) 出近6千億(yi) 的堿基序列。經過序列組裝和基因注釋分析，從(cong) 中獲得330萬(wan) 個(ge) 非冗餘(yu) 的人體(ti) 腸道元基因組的參考基因，約是人自身基因的50倍。這個(ge) 基因集中包含了絕大部分目前已知的人體(ti) 腸道微生物基因，但更多的是目前未知微生物的基因。從(cong) 這個(ge) 基因集中可以估計人腸道中存在約000到50種細菌，平均每個(ge) 體(ti) 內(nei) 約含有60種優(you) 勢菌種，並且這些細菌是絕大部分個(ge) 體(ti) 所共有的。hth体育下载地址

    人體(ti) 微生物的研究可能成為(wei) 科學家們(men) 的新熱點課題，時間過去3年，這一預測就得到實現，隨著腸道微生物基因組計劃，腸道微生物與(yu) 代謝疾病的研究步伐的加速，腸道微生物研究受到的重視。