總RNA提取可以:()獲得高純度、高質量的總RNA;(2)可以滿足生物學下遊實驗NorthernBlot、核酸酶保護實驗、RT-PCR、qRT-PCR 和陣列分析所需。
實驗方法原理 總RNA 提取試劑盒,可以用來製備高質量的可用於(yu) 建庫的RNA 。該總RNA 純化係統采用兩(liang) 種的RNA酶抑製劑,異硫氰酸弧(GTC)和β-巰基乙醇,加上整個(ge) 操作都在冰浴下進行,這樣就能顯著降低RNA 的降解速率。
GTC和N-十二烷基肌氨酸鈉的聯合使用,將促使核蛋白複合體(ti) 的解離,使RNA 與(yu) 蛋白質分離,並將RNA釋放到溶液中。而進一步從(cong) 複合體(ti) 中純化RNA ,則根據Chomczynski和Sacchi的一步快速抽提法進行,采用酸性酚-氯仿混合液抽提。低pH值的酚將使RNA進入水相,這樣使其與(yu) 仍留在有機相中的蛋白質和DNA分離。水相中的RNA 可用異丙醇沉澱濃縮。進一步將上述RNA沉澱複溶於(yu) GTC溶液中,接著用異丙醇進行二次沉澱,隨後用乙醇洗滌沉澱,即可去除所有殘留的蛋白質和無機鹽,而RNA 中如含無機鹽,則有可能對以後操作中的一些酶促反應產(chan) 生抑製。
實驗材料 微生物 動物細胞 植物組織
試劑、試劑盒 RNA 提取試劑盒 焦碳酸二乙酯 乙醇
儀(yi) 器、耗材 恒溫水浴 冷凍高速離心機 紫外分光光度計 取液器 電泳儀(yi) 電泳槽
實驗步驟 一、細胞或組織破碎
. 微生物材料
()發酵3-4天(或對數生)的菌體(ti) ,離心收集菌絲(si) 體(ti) (動植物材料無需此步處理)。
(2)用經DEPC處理的水洗菌絲(si) 體(ti) 2-3次,並盡量除去殘存的水。
(3)加液氮充分研磨,使其成為(wei) 粉末,以釋放RNA。
(4)研磨後的樣品轉移至2 ml變性液的容器中勻漿。
2. 動植物細胞培養(yang) 材料 (適用的樣品量為(wei) 細胞:08)
()細胞或組織培養(yang) :按常規方法進行。
(2)深層懸浮培養(yang) 細胞的破碎。
①細胞收集:含一定濃度的細胞培養(yang) 液置於(yu) 無菌離心管中,4℃,3 000 g離心5分鍾。
②細胞洗滌:上步沉澱用25毫升滅菌後冰凍的×PBS緩衝(chong) 液洗滌,然後4℃,3 000 g離心5分鍾。
③細胞破碎:在沉澱細胞中加入5 ml預冷的變性液,用無菌處理過的勻漿器勻漿。
3. 表麵培養(yang) 細胞的破碎
()確定培養(yang) 瓶數量,使選定的各培養(yang) 瓶細胞累加後總量達08。
(2)細胞收集:將培養(yang) 液倒掉,用預冷的無菌PBS緩衝(chong) 液洗滌一次,在培養(yang) 瓶中加入8 ml預冷變性液,轉動培養(yang) 瓶,使細胞溶解,此時可見粘度加大。
(3)用無菌吸管將*個(ge) 培養(yang) 瓶中的液體(ti) 吸入第二個(ge) 培養(yang) 瓶,旋轉,溶解細胞,再吸入第三個(ge) 培養(yang) 瓶,以此類推,直到將所選定的培養(yang) 瓶全部洗滌一次,然後從(cong) *個(ge) 培養(yang) 瓶開始再加入4毫升上述變性液,將所有培養(yang) 瓶洗一次。
(4)將上述2 ml含細胞的變性液轉移至一50毫升無菌離心管中,勻漿破碎細胞。
3. 植物組織破碎 (適用的樣品量為(wei) 0.05 g組織)
()將600 ul變性液置於(yu) .5 ml離心管中,將此離心管放於(yu) 冰浴中5分鍾。
(2)將0.05 g新鮮組織用液氮冰凍。
(3)在液氮下,研磨組織塊。
(4)待液氮揮發後,將上述分散的組織轉移至無菌離心管中。
4. 動物組織破碎 (適用的樣品量為(wei) g 組織)
()將2 ml變性液置於(yu) 50 ml離心管中,將此離心管放於(yu) 冰浴中5分鍾。
(2)在上述管中加入 g新鮮或冰凍動物組織,勻漿粉碎。
二、RNA 的抽提
() 在經變性液勻漿的細胞或組織600 ul+60 ul pH4.0的2 M 乙酸鈉*混勻,可用漩渦振蕩器。
(2)600 ul酚\氯仿\異戊醇(25\24\),*混勻或漩渦振蕩器振蕩0秒。
(3)冰裕中0-5分鍾,離心,4℃,0 000 g,20分鍾。
(4)上層水相吸至無菌離心管中+等體(ti) 積的異丙醇,-70℃,30分鍾沉澱RNA。
(5)離心4℃,0 000g,20分鍾。
(6)沉澱RNA ,冷凍幹燥5分鍾 , RNA 沉澱重新溶於(yu) 300 ul變性液中,可振蕩(有時為(wei) 了幫助溶解,可在65℃加熱,但時間應極短)。
(7) 60 ul pH4.0的2M乙酸鈉*混勻,可用漩渦振蕩器。
(8) 600 ul酚\氯仿\異戊醇(25\24\),*混勻或漩渦振蕩器振蕩0秒。
(9) 冰裕中0-5分鍾,離心,4℃,0 000 g,20分鍾。
(0)上層水相吸至無菌離心管中。
() 等體(ti) 積異丙醇二次沉澱(-70℃,30分鍾),75%乙醇洗沉澱,沉澱冷凍幹燥,複溶於(yu) 去RNA 酶的水中(對於(yu) 準備保存的RNA 可加入pH 5.0的乙酸鈉至終濃度為(wei) 0.25 M,再加入2.5體(ti) 積的乙醇,-70℃保存。)。
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